Zygmunt Ajdukiewicz urodził się 22 stycznia 1861 roku w Witkowicach pod Tarnobrzegiem. Był bratem stryjecznym Tadeusza Ajdukiewicza. Naukę malarstwa rozpoczął w krakowskiej Szkole Sztuk Pięknych, następnie w latach 1880-82 studiował w wiedeńskiej Akademii, później w Monachium. W 1885 roku osiadł na stałe w Wiedniu, gdzie kuzyn Tadeusz ułatwił mu dostęp do kręgów arystokratycznych i dworu cesarskiego. W 1891 roku został członkiem stowarzyszenia artystów austriackich „Wiener Künstlerhaus” (Wiedeński Dom Artystów). W 1893 roku udał się do Paryża. Pod koniec XIX w. przez pewien czas pracował w Sarajewie jako ilustrator czasopisma „Nada”. W roku 1893 odwiedził także Paryż. Zygmunt Ajdukiewicz wystawiał swoje obrazy od 1882 roku w Krakowie, w Warszawie, we Lwowie, w Wiedniu, Berlinie, Monachium, Pradze. Malował portrety, sceny rodzajowe o tematyce myśliwskiej oraz obrazy historyczne. Zajmował się także ilustratorstwem. Jego dzieła znajdują się w Muzeach Narodowych w Warszawie, Krakowie i Wrocławiu, w Muzeum Górnośląskim w Bytomiu oraz w Wiedniu, w Ratuszu. Artysta zmarł 29 kwietnia 1917 roku w Wiedniu.